ඉතියෝපියාවේ SARS-CoV-2 හඳුනා ගැනීම සඳහා න්‍යෂ්ටික අම්ල විස්තාරණ පරීක්ෂණ හතරක කාර්ය සාධනය.

Nature.com වෙත පිවිසීම ගැන ඔබට ස්තූතියි. ඔබ සීමිත CSS සහායක් සහිත බ්‍රව්සර් අනුවාදයක් භාවිතා කරයි. හොඳම අත්දැකීම සඳහා, යාවත්කාලීන කළ බ්‍රව්සරයක් භාවිතා කරන ලෙස අපි නිර්දේශ කරමු (නැතහොත් Internet Explorer හි අනුකූලතා මාදිලිය අක්‍රීය කරන්න). ඊට අමතරව, අඛණ්ඩ සහාය සහතික කිරීම සඳහා, අපි විලාස සහ JavaScript නොමැතිව අඩවිය පෙන්වමු.
එකවර ස්ලයිඩ තුනක කැරොසලයක් පෙන්වයි. එකවර ස්ලයිඩ තුනක් හරහා ගමන් කිරීමට පෙර සහ ඊළඟ බොත්තම් භාවිතා කරන්න, නැතහොත් අවසානයේ ඇති ස්ලයිඩර් බොත්තම් භාවිතා කර එකවර ස්ලයිඩ තුනක් හරහා ගමන් කරන්න.
2019 කොරෝනා වයිරස් රෝගය (COVID-19) පැතිරීමෙන් පසු, බොහෝ වාණිජ න්‍යෂ්ටික අම්ල විස්තාරණ පරීක්ෂණ (NAAT) ලොව පුරා සංවර්ධනය කර ඇති අතර ඒවා සම්මත පරීක්ෂණ බවට පත්ව ඇත. පරීක්ෂණ කිහිපයක් ඉක්මනින් සංවර්ධනය කර රසායනාගාර රෝග විනිශ්චය පරීක්ෂණ සඳහා යොදන ලද නමුත්, මෙම පරීක්ෂණවල කාර්ය සාධනය විවිධ සැකසුම් තුළ ඇගයීමට ලක් කර නොමැත. එබැවින්, මෙම අධ්‍යයනය අරමුණු කළේ සංයුක්ත යොමු ප්‍රමිතිය (CRS) භාවිතයෙන් ඇබට් SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI සහ Sansure Biotech පරීක්ෂණවල ක්‍රියාකාරිත්වය ඇගයීමයි. මෙම අධ්‍යයනය 2020 දෙසැම්බර් 1 සිට 30 දක්වා ඉතියෝපියානු මහජන සෞඛ්‍ය ආයතනයේ (EPHI) සිදු කරන ලදී. QIAamp RNA කුඩා කට්ටලය සහ ඇබට් DNA සාම්පල සකස් කිරීමේ පද්ධතිය භාවිතයෙන් නාසෝෆරින්ජියල් සාම්පල 164 ක් ලබා ගන්නා ලදී. නිදර්ශක 164 න් 59.1% ක් ධනාත්මක වූ අතර 40.9% ක් CRS සඳහා සෘණ විය. CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech ධනාත්මක බව සැලකිය යුතු ලෙස අඩු විය. CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech ධනාත්මක බව සැලකිය යුතු ලෙස අඩු විය. Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p <0,05). CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech හි ධනාත්මක ප්‍රතිඵල සැලකිය යුතු ලෙස අඩු විය.与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）。与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）。 У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech සතුව සැලකිය යුතු ලෙස අඩු ධනාත්මක ප්‍රතිඵල තිබුණි.CRS හා සසඳන විට විශ්ලේෂණ හතරේ සමස්ත එකඟතාවය 96.3–100% ක් විය. Sansure Biotech විශ්ලේෂණයේ අඩු ධනාත්මක අනුපාතයට අමතරව, පරීක්ෂණ හතරේ කාර්ය සාධනය බොහෝ දුරට සැසඳිය හැකි විය. එබැවින්, Sansure Biotech [පර්යේෂණ සඳහා පමණි (RUO)] විශ්ලේෂණය ඉතියෝපියාවේ එහි භාවිතය සඳහා අමතර වලංගුකරණයක් අවශ්‍ය වේ. අවසාන වශයෙන්, සුදුසු නිෂ්පාදකයාගේ හිමිකම් සමඟ පරීක්ෂණ ඇගයීම සඳහා අතිරේක පර්යේෂණ සලකා බැලිය යුතුය.
රසායනාගාර පරීක්ෂණ යනු ලෝක සෞඛ්‍ය සංවිධානයේ (WHO) කොරෝනා වයිරස් රෝග 2019 (COVID-19) සූදානම සහ ප්‍රතිචාර දැක්වීම (SPRP) සඳහා වන උපායමාර්ගික සැලැස්මේ කොටසකි. ලෝක සෞඛ්‍ය සංවිධානය උපදෙස් දෙන්නේ රටවල් සූදානම, නිසි නඩු කළමනාකරණය, සුපරීක්ෂාකාරීත්වය සහ මහජන සෞඛ්‍ය අභියෝගවලට වේගවත් ප්‍රතිචාර දැක්වීම වැඩි දියුණු කිරීම සඳහා රසායනාගාර ධාරිතාව ගොඩනැගීමට අවශ්‍ය බවයි. මෙයින් ඇඟවෙන්නේ නැගී එන බෝවන කාරකයන්ගේ රෝගය සහ වසංගත රෝග විද්‍යාව සංලක්ෂිත කිරීමට සහ ඒවායේ පැතිරීම පාලනය කිරීමට රසායනාගාරයේ කාර්යභාරය ප්‍රධාන බවයි.
COVID-19 රෝග විනිශ්චය සඳහා වසංගත රෝග සහ වෛද්‍ය තොරතුරු, පුද්ගලික රෝග ලක්ෂණ/ලකුණු සහ විකිරණ සහ රසායනාගාර දත්ත අවශ්‍ය වේ2. COVID-19 පැතිරීම චීනයේ වුහාන් හි වාර්තා වූ දා සිට, ලොව පුරා බොහෝ වාණිජ න්‍යෂ්ටික අම්ල විස්තාරණ පරීක්ෂණ (NAAT) සංවර්ධනය කර ඇත. දරුණු උග්‍ර ශ්වසන සින්ඩ්‍රෝමය 2 (SARS-CoV-2)3 ආසාදනයේ රසායනාගාර රෝග විනිශ්චය සඳහා සාමාන්‍ය සහ සම්මත ක්‍රමයක් ලෙස තත්‍ය කාලීන ප්‍රතිලෝම පිටපත් කිරීමේ පොලිමරේස් දාම ප්‍රතික්‍රියාව (rRT-PCR) භාවිතා කර ඇත. SARS-CoV-2 හි අණුක හඳුනාගැනීම සාමාන්‍යයෙන් පදනම් වන්නේ ORF1a/b (විවෘත කියවීමේ රාමුව 1a/b) ජාන කලාපයේ N (නියුක්ලියෝකැප්සිඩ් ප්‍රෝටීන් ජානය), E (ලියුම් කවර ප්‍රෝටීන් ජානය) සහ RdRp (RNA-යැපෙන RNA පොලිමරේස් ජානය) ජාන මත ය. වෛරස් ජෙනෝමයෙන් හඳුනාගත් ප්‍රධාන සංරක්ෂිත කලාප ලෙස ඒවා සැලකේ4. මෙම ජාන අතර, RdRp සහ E ජානවලට ඉහළ විශ්ලේෂණාත්මක හඳුනාගැනීමේ සංවේදීතාවයක් ඇති අතර N ජානයට අඩු විශ්ලේෂණාත්මක සංවේදීතාවයක් ඇත5.
PCR පරීක්ෂණවල කාර්ය සාධනය විවිධ සාධක මත පදනම්ව වෙනස් විය හැකිය: නිස්සාරණ ප්‍රතික්‍රියාකාරක, විස්තාරණ/අනාවරණ ප්‍රතික්‍රියාකාරක, නිස්සාරණ ක්‍රමය, PCR යන්ත්‍රයේ ගුණාත්මකභාවය සහ අනෙකුත් උපකරණ. 2020 අප්‍රේල් වන විට, රටවල් නවයකින් විවිධ රෝග විනිශ්චය උපාංග 48 කට වඩා COVID-196 රෝග විනිශ්චය සඳහා හදිසි භාවිත අවසරය (EUA) ලබාගෙන ඇත. ඉතියෝපියාවේ, ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 සහ Quant-studio7 ඇතුළු මහජන සෞඛ්‍ය ආයතන 26 ක SARS-CoV-2 PCR හඳුනාගැනීම සඳහා තත්‍ය කාලීන PCR වේදිකා 14 කට වඩා භාවිතා කරනු ලැබේ. ඊට අමතරව, Daan Gene පරීක්ෂණය, Abbott SARS-CoV-2 පරීක්ෂණය, Sansure Biotech පරීක්ෂණය සහ SARS-CoV-2 BGI පරීක්ෂණය වැනි විවිධ PCR පරීක්ෂණ කට්ටල තිබේ. rRT-PCR ඉතා සංවේදී වුවද, COVID-19 ඇති සමහර රෝගීන් නුසුදුසු එකතු කිරීම, ප්‍රවාහනය, ගබඩා කිරීම සහ හැසිරවීම සහ රසායනාගාර පරීක්ෂණ හේතුවෙන් සාම්පලවල වෛරස් රයිබොනියුක්ලික් අම්ලයේ (RNA) පිටපත් ප්‍රමාණවත් නොවීම හේතුවෙන් ව්‍යාජ සෘණාත්මක ප්‍රතිඵල වාර්තා කරයි. පිරිස් තත්වයන් සහ ක්‍රියා 8. ඊට අමතරව, නියැදි හෝ පාලන වැරදි ලෙස හැසිරවීම, චක්‍ර සීමාව (Ct) සැකසීම සහ අනෙකුත් ව්යාධිජනක න්‍යෂ්ටික අම්ල හෝ අක්‍රිය/අවශේෂ SARS-CoV-2 RNA සමඟ හරස් ප්‍රතික්‍රියාශීලීත්වය rRT-PCR9 පරීක්ෂණ වලදී ව්‍යාජ ධනාත්මක ප්‍රතිඵලවලට හේතු විය හැක. මේ අනුව, PCR පරීක්ෂණ මගින් ජාන කොටස්වල වාහකයන් සැබවින්ම හඳුනාගත හැකි බව පැහැදිලිය, මන්ද ඒවාට සැබවින්ම ක්‍රියාකාරී වෛරස් ජාන අතර වෙනස පවා වෙන්කර හඳුනාගත නොහැකි බැවින්, පරීක්ෂණවලට හඳුනාගත හැක්කේ වාහකයන් පමණක් වන අතර රෝගීන් නොවේ10. එබැවින්, අපගේ සැකසුම තුළ සම්මත ක්‍රම භාවිතයෙන් රෝග විනිශ්චය කාර්ය සාධනය තක්සේරු කිරීම වැදගත් වේ. බොහෝ NAAT ප්‍රතික්‍රියාකාරක ඉතියෝපියානු මහජන සෞඛ්‍ය ආයතනයේ (EPHI) සහ රට පුරා ලබා ගත හැකි වුවද, ඒවායේ කාර්යක්ෂමතාව පිළිබඳ සංසන්දනාත්මක ඇගයීමක් තවමත් වාර්තා වී නොමැත. එබැවින්, සායනික නිදර්ශක භාවිතයෙන් rRT-PCR මගින් SARS-CoV-2 හඳුනා ගැනීම සඳහා වාණිජමය වශයෙන් ලබා ගත හැකි කට්ටලවල සංසන්දනාත්මක කාර්ය සාධනය ඇගයීම මෙම අධ්‍යයනයේ අරමුණ විය.
මෙම අධ්‍යයනයට COVID-19 සැක සහිත සහභාගිවන්නන් 164 දෙනෙකු ඇතුළත් කරන ලදී. සාම්පල බහුතරයක් ප්‍රතිකාර මධ්‍යස්ථානවලින් (118/164 = 72%) ලැබුණු අතර, ඉතිරි 46 (28%) සහභාගිවන්නන් ප්‍රතිකාර නොකරන මධ්‍යස්ථානවලින් පැමිණි අය වූහ. මධ්‍යස්ථානයේ ප්‍රතිකාර නොකළ සහභාගිවන්නන් අතරින්, 15 (9.1%) දෙනෙකුට සායනිකව සැක සහිත රෝගීන් සිටි අතර 31 (18.9%) දෙනෙකුට තහවුරු කරන ලද රෝගීන් සමඟ සම්බන්ධතා තිබුණි. සහභාගිවන්නන් අනූතුන් දෙනෙකු (56.7%) පිරිමින් වූ අතර, සහභාගිවන්නන්ගේ සාමාන්‍ය (± SD) වයස අවුරුදු 31.10 (± 11.82) විය.
මෙම අධ්‍යයනයේ දී, COVID-19 සඳහා වන පරීක්ෂණ හතරක ධනාත්මක සහ සෘණ අනුපාත තීරණය කරන ලදී. මේ අනුව, ඇබට් SARS-CoV-2 පරීක්ෂණය, Daan Gene 2019-nCoV පරීක්ෂණය, SARS-CoV-2 BGI පරීක්ෂණය සහ Sansure Biotech 2019-nCoV පරීක්ෂණයේ ධනාත්මක අනුපාත පිළිවෙලින් 59.1%, 58.5%, 57.9% සහ 55.5% විය. ධනාත්මක සහ සෘණ සංයුක්ත යොමු ප්‍රමිතිය (CRS) ලකුණු පිළිවෙලින් 97 (59.1%) සහ 67 (40.9%) විය (වගුව 1). මෙම අධ්‍යයනයේ දී, CRS හි අර්ථ දැක්වීම "ඕනෑම ධනාත්මක" රීතිය මත පදනම් වූ අතර, එමඟින් පරීක්ෂණ ප්‍රතිඵල හතරෙන්, එකම ප්‍රතිඵලය ලබා දුන් පරීක්ෂණ ප්‍රතිඵල දෙකක් හෝ වැඩි ගණනක් සැබෑ ධනාත්මක හෝ සෘණ ලෙස සැලකේ.
මෙම අධ්‍යයනයේ දී, CRS හා සසඳන විට සියලුම විශ්ලේෂණයන් සඳහා 100% (95% CI 94.6–100) ක සෘණ ප්‍රතිශත එකඟතාවයක් (NPA) අපට හමු විය. Sansure Biotechnology විශ්ලේෂණයෙන් 93.8% (95% CI 87.2-97.1) ක අවම PPA එකක් පෙන්නුම් කළ අතර Daan Gene 2019-nCoV විශ්ලේෂණයෙන් 99.4% (95% CI 96.6-99.9) ක සමස්ත එකඟතාවයක් තිබුණි. ඊට වෙනස්ව, SARS-CoV-2 BGI විශ්ලේෂණය සහ Sansure Biotech 2019-nCoV විශ්ලේෂණය අතර සමස්ත එකඟතාවය පිළිවෙලින් 98.8% සහ 96.3% විය (වගුව 2).
CRS සහ ඇබට් SARS-CoV-2 පරීක්ෂණ ප්‍රතිඵල අතර කොහෙන්ගේ එකඟතා කප්පා සංගුණකය සම්පූර්ණයෙන්ම අනුකූල විය (K = 1.00). ඒ හා සමානව, Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, සහ Sansure Biotech 2019-nCoV මගින් අනාවරණය කරගත් කොහෙන්ගේ කප්පා අගයන් ද CRS (K ≥ 0.925) සමඟ සම්පූර්ණයෙන්ම අනුකූල වේ. මෙම සංසන්දනාත්මක විශ්ලේෂණයේදී, chi-square පරීක්ෂණය (McNemar පරීක්ෂණය) පෙන්නුම් කළේ Sansure Biotech 2019-nCoV පරීක්ෂණ ප්‍රතිඵල CRS ප්‍රතිඵලවලට වඩා සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් බවයි (p = 0.031) (වගුව 2).
රූපයේ දැක්වෙන පරිදි.1 ඇබට් SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණයේ (RdRp සහ N ජානය ඒකාබද්ධ) අඩුම Ct අගයේ (<20 Ct) ප්‍රතිශතය 87.6% ක් වූ අතර Sansure Biotech 2019-nCoV විශ්ලේෂණයේ ORF1a/b ජාන Ct අගය පෙන්නුම් කළේ අඩු Ct අගයේ (<20 Ct) ප්‍රතිශතය 50.3% ක් සහ ඉහළ Ct අගය (36–40 Ct) 3.2% ක් බවයි. 1 ඇබට් SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණයේ (RdRp සහ N ජානය ඒකාබද්ධ) අඩුම Ct අගයේ (<20 Ct) ප්‍රතිශතය 87.6% ක් වූ අතර Sansure Biotech 2019-nCoV විශ්ලේෂණයේ ORF1a/b ජාන Ct අගය පෙන්නුම් කළේ අඩු Ct අගයේ (<20 Ct) ප්‍රතිශතය 50.3% ක් සහ ඉහළ Ct අගය (36–40 Ct) 3.2% ක් බවයි.රූපයේ දැක්වෙන පරිදි.1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) анализа Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) состанизение гена ORF1a/b анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял 50,3% (36-40 Ct) составляло 3,2%. 1, ඇබට් SARS-CoV-2 (ඒකාබද්ධ ජානය RdRp සහ N) හි අඩුම Ct අගය (<20 Ct) විශ්ලේෂණයේ ප්‍රතිශතය 87.6% ක් වූ අතර, Sansure Biotech 2019-nCoV හි ORF1a/b ජාන විශ්ලේෂණයේ Ct අගය පෙන්නුම් කළේ අඩු Ct අගය (<20 Ct) ප්‍රතිශතය 50.3% ක් වන අතර ඉහළ අගය Ct (36–40 Ct) 3.2% ක් වන බවයි.如图1 所示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20% Bitech,S7.7%. 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%,高Ct 值(36–40 Ct)的百分比为3.2%。 රූප සටහන 1 හි දැක්වෙන පරිදි, ඇබට් SARS-CoV-2 පරීක්ෂණයේ (RdRp සහ N ජානයේ සංයෝජනය) අඩුම Ct අගය ප්‍රතිශතය (<20 Ct) 87.6% වන අතර, Sansure Biotech 2019-nCoV පරීක්ෂණයේ ORF1a/b ජානයේ Ct අගය අඩු Ct (<20 Ct) 的 ප්‍රතිශතය 50.3% ක් වන අතර, 高Ct 值(36–40 Ct) 的 ප්‍රතිශතය 3.2% කි. Как показано на рисунке 1, анлиз Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp සහ N) имел самое низкое просентент Ct) 87,6%, ප්‍රසිද්ධ Ct GANA ORF1a/b в исследовании Sansure Biotech 2019- ඇනලිස් nCoV පොකසල් низкий රූප සටහන 1 හි පෙන්වා ඇති පරිදි, ඇබට් SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණය (RdRp සහ N ජාන ඒකාබද්ධ කිරීම) 87.6% ක අඩුම ප්‍රතිශත Ct අගය (<20 Ct) ඇති අතර, Sansure Biotech 2019 අධ්‍යයනයේ ORF1a/b ජානයේ Ct අගය - nCoV විශ්ලේෂණය අඩු Ct අගයක් පෙන්නුම් කළේය. Процент значений (< 20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36-40 Ct) составил 3,2%. අගයන්හි ප්‍රතිශතය (<20 Ct) 50.3% ක් වූ අතර ඉහළ Ct අගයන්හි ප්‍රතිශතය (36-40 Ct) 3.2% කි.ඇබට් SARS-CoV-2 B පරීක්ෂණයේදී Ct අගයන් 30 ට වඩා වැඩි විය. අනෙක් අතට, BGI SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණයේදී ORF1a/b ජානයේ ඉහළ Ct අගයක් (> 36 Ct) ප්‍රතිශතයක් 4% ක් විය (රූපය 1). අනෙක් අතට, BGI SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණයේදී ORF1a/b ජානයේ ඉහළ Ct අගයක් (> 36 Ct) ප්‍රතිශතයක් 4% ක් විය (රූපය 1). С другой стороны, анлизе BGI SARS-CoV-2 gen ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент котороны 1) අනෙක් අතට, BGI SARS-CoV-2 ජානයේ විශ්ලේෂණයේදී ORF1a/b හි ඉහළ Ct අගයක් (> 36 Ct) තිබුණි, එහි ප්‍රතිශතය 4% කි (රූපය 1).另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比为4% අනෙක් අතට, BGI SARS-CoV-2 හඳුනාගැනීමේදී, ඉහළ Ct අගයක් (>36 Ct) සහිත ORF1a/b ජානයේ ප්‍රතිශතය 4% කි (රූපය 1). С другой стороны, в алализе BGI SARS-CoV-2 ප්‍රොසෙන්ට් ජෙනෝව් ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) со.4став). අනෙක් අතට, BGI SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණයේ දී, ඉහළ Ct අගයන් (>36 Ct) සහිත ORF1a/b ජානවල ප්‍රතිශතය 4% කි (රූපය 1).
මෙම අධ්‍යයනයේ දී, අපි නාසෝෆරින්ජියල් සාම්පල 164 ක් ලබා ගත්තෙමු. සියලු වර්ගවල පරීක්ෂණ සඳහා, අදාළ නිෂ්පාදකයින් විසින් නිර්දේශ කරන ලද ක්‍රම සහ කට්ටල භාවිතා කරමින් RNA හුදකලා කිරීම සහ විස්තාරණය සිදු කරන ලදී.
මෙම අධ්‍යයනයෙන් පෙන්නුම් කළේ SARS-CoV-2 සඳහා ඇබට්ගේ පරීක්ෂණය CRS හා සමාන හඳුනාගැනීමේ කාර්ය සාධනයක් ඇති බවත්, 100% ධනාත්මක, සෘණ සහ සමස්ත අනුකූලතාවයෙන් යුක්ත බවත්ය. කොහෙන්ගේ කැපා ගිවිසුම 1.00 වන අතර එය CRS සමඟ සම්පූර්ණ එකඟතාවයක් පෙන්නුම් කරයි. එක්සත් ජනපදයේ වොෂින්ටන් විශ්ව විද්‍යාලය විසින් කරන ලද සමාන අධ්‍යයනයකින් හෙළි වූයේ CDC හි රසායනාගාර-නිශ්චිත තක්සේරුව (LDA) හා සසඳන විට SARS-CoV-2 සඳහා ඇබට් පරීක්ෂණයේ සමස්ත සංවේදීතාව සහ විශේෂත්වය පිළිවෙලින් 93% සහ 100% ක් බවයි. 11. ඇබට් SARS-CoV-2 හඳුනාගැනීමේ පද්ධතිය පදනම් වී ඇත්තේ N සහ RdRp ජාන එකවර ඒකාබද්ධව හඳුනා ගැනීම මත වන අතර, ජාන දෙකම වඩාත් සංවේදී බැවින්, ව්‍යාජ සෘණ අවම කරයි12. ඔස්ට්‍රියාවේ වියානාහි කරන ලද අධ්‍යයනයකින් පෙන්නුම් කළේ විශාල නිස්සාරණ සාම්පල පරිමාවන් සහ හඳුනාගැනීමේ ප්‍රභාකරන් පරිමාවන් තනුක බලපෑම් අවම කර හඳුනාගැනීමේ කාර්යක්ෂමතාව වැඩි කරන බවයි13. මේ අනුව, SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණය සඳහා ඇබට්ගේ පරිපූර්ණ ගැලපීම, එකවර සංයුක්ත ජාන හඳුනා ගන්නා, සාම්පල විශාල සංඛ්‍යාවක් (මිලි ලීටර් 0.5) නිස්සාරණය කරන සහ විශාල ප්‍රමාණයක් (40 µl) භාවිතා කරන වේදිකා හඳුනාගැනීමේ පද්ධතියක් සමඟ සම්බන්ධ කළ හැකිය.
අපගේ ප්‍රතිඵලවලින් පෙන්නුම් කළේ Daan ජාන පරීක්ෂණයේ හඳුනාගැනීමේ කාර්ය සාධනය CRS හි ක්‍රියාකාරිත්වයට බොහෝ දුරට සමාන බවයි. මෙය චීනයේ හුවයිනාන් හි අන්හුයි විශ්ව විද්‍යාලයේ සිදු කරන ලද අධ්‍යයනයකට සහ නිෂ්පාදකයාගේ 100% ධනාත්මක එකඟතාවයක් පිළිබඳ ප්‍රකාශයට අනුකූල වේ. ස්ථාවර ප්‍රතිඵල වාර්තා තිබියදීත්, එකම එලියුටේට් නැවත පරීක්ෂා කිරීමෙන් පසු එක් සාම්පලයක් ව්‍යාජ සෘණාත්මක වූ නමුත් ඇබට් SARS-CoV-2 සහ Sansure Biotech nCoV-2019 පරීක්ෂණ වලදී ධනාත්මක විය. මෙයින් ඇඟවෙන්නේ විවිධ වර්ගයේ පරීක්ෂණ හරහා ප්‍රතිඵලවල විචල්‍යතාවයක් තිබිය හැකි බවයි. කෙසේ වෙතත්, චීනයේ සිදු කරන ලද අධ්‍යයනයේ දී15, Daan ජාන විශ්ලේෂණයේ ප්‍රතිඵලය ඔවුන්ගේ රසායනාගාර-නිර්වචනය කරන ලද යොමු විශ්ලේෂණයට සාපේක්ෂව සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් විය (p < 0.05). කෙසේ වෙතත්, චීනයේ සිදු කරන ලද අධ්‍යයනයේ දී15, Daan ජාන විශ්ලේෂණයේ ප්‍රතිඵලය ඔවුන්ගේ රසායනාගාර-නිර්වචනය කරන ලද යොමු විශ්ලේෂණයට සාපේක්ෂව සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් විය (p < 0.05). Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался, 5000 laboratornogo etalonnogo analiza. කෙසේ වෙතත්, චීනයේ අධ්‍යයනයක දී15, Daan Gene ගේ විශ්ලේෂණ ප්‍රතිඵලය ඔවුන්ගේ රසායනාගාර විමර්ශන විශ්ලේෂණයට වඩා සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් විය (p < 0.05).然而，在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异（p <0.05).然而，在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差<0.05 Однако в исследовании, проведеном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно <пил, отли 5) сравнению с ego etalonnыm laboratornыm testom. කෙසේ වෙතත්, චීනයේ කරන ලද අධ්‍යයනයක දී15, ඩෑන්ගේ ජාන පරීක්ෂණයේ ප්‍රතිඵල එහි යොමු රසායනාගාර පරීක්ෂණයට සාපේක්ෂව සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් විය (p < 0.05).මෙම විෂමතාවය SARS-CoV-2 හඳුනා ගැනීම සඳහා වූ විමර්ශන පරීක්ෂණයේ සංවේදීතාව නිසා විය හැකි අතර, හේතුව තීරණය කිරීම සඳහා වැඩිදුර අධ්‍යයනයන් වැදගත් විය හැකිය.
ඊට අමතරව, අපගේ අධ්‍යයනය මගින් CRS සමඟ SARS-CoV-2 BGI විශ්ලේෂණයේ සංසන්දනාත්මක කාර්ය සාධනය ඇගයීමට ලක් කළ අතර, විශිෂ්ට ධනාත්මක ප්‍රතිශත එකඟතාවයක් (PPA = 97.9%), සෘණ ප්‍රතිශත එකඟතාවයක් (NPA = 100%) සහ ස්ත්‍රී පුරුෂ භාවය අනුව සමස්ත ප්‍රතිශත එකඟතාවයක් (OPA) පෙන්නුම් කළේය. = 98.8%). කොහෙන්ගේ කප්පා අගයන් හොඳ එකඟතාවයක් පෙන්නුම් කළේය (K = 0.975). නෙදර්ලන්තය16 සහ චීනය15 හි අධ්‍යයනයන් ස්ථාවර ප්‍රතිඵල පෙන්වා ඇත. SARS-CoV-2 BGI පරීක්ෂණය 10 µl විස්තාරණය/අනාවරණය ඉවත් කිරීම භාවිතා කරන තනි ජාන (ORF1a/b) හඳුනාගැනීමේ පරීක්ෂණයකි. අපගේ යොමු ප්‍රතිඵල සමඟ හොඳ සංඛ්‍යානමය එකඟතාවයක් තිබියදීත්, විශ්ලේෂණයට මුළු සාම්පලයෙන් ධනාත්මක සාම්පල දෙකක් (1.22%) මග හැරුණි. මෙය රෝගියා සහ ප්‍රජා මට්ටම් දෙකෙහිම සම්ප්‍රේෂණ ගතිකත්වය සඳහා විශාල සායනික ඇඟවුම් ඇති කළ හැකිය.
මෙම අධ්‍යයනයට ඇතුළත් කර ඇති තවත් සංසන්දනාත්මක විශ්ලේෂණයක් වූයේ Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) විශ්ලේෂණයයි; සමස්ත ගැලපුම් ප්‍රතිශතය 96.3% කි. එකඟතාවයේ ශක්තිය ද කොහෙන්ගේ කප්පා අගය මගින් තීරණය කරන ලද අතර එය 0.925 ක් වූ අතර එය CRS සමඟ සම්පූර්ණ එකඟතාවයක් පෙන්නුම් කරයි. නැවතත්, අපගේ ප්‍රතිඵල චීනයේ චැංෂා හි මධ්‍යම දකුණු විශ්ව විද්‍යාලයේ සහ චීනයේ ලියුෂෝ නගරයේ ලියුෂෝ මහජන රෝහලේ සායනික රසායනාගාර දෙපාර්තමේන්තුවේ සිදු කරන ලද අධ්‍යයනයන්ට සමාන වේ17. ඉහත හොඳ සංඛ්‍යානමය අනුකූලතාව වාර්තා වුවද, කයි-චතුරස්‍ර පරීක්ෂණය (මැක්නෙමාර් පරීක්ෂණය) පෙන්නුම් කළේ සැන්සුර් බයෝටෙක් විශ්ලේෂණයේ ප්‍රතිඵලය CRS (p < 0.005) හා සසඳන විට සංඛ්‍යානමය වශයෙන් සැලකිය යුතු වෙනසක් ඇති බවයි. ඉහත හොඳ සංඛ්‍යානමය අනුකූලතාව වාර්තා වුවද, කයි-චතුරස්‍ර පරීක්ෂණය (මැක්නෙමාර් පරීක්ෂණය) පෙන්නුම් කළේ සැන්සුර් බයෝටෙක් විශ්ලේෂණයේ ප්‍රතිඵලය CRS (p < 0.005) හා සසඳන විට සංඛ්‍යානමය වශයෙන් සැලකිය යුතු වෙනසක් ඇති බවයි. Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое сответветствие, икто было (ක්‍රිටරි මැක්නමරා) 0,005). ඉහත හොඳ සංඛ්‍යානමය එකඟතාවයක් වාර්තා වුවද, කයි-චතුරස්‍ර පරීක්ෂණය (මැක්නෙමාර් පරීක්ෂණය) පෙන්නුම් කළේ සැන්සුර් බයෝටෙක් විශ්ලේෂණයේ ප්‍රතිඵලය CRS (p < 0.005) හා සසඳන විට සංඛ්‍යානමය වශයෙන් සැලකිය යුතු වෙනසක් ඇති බවයි.尽管记录了上述良好的统计一致性，但卡方检验（MacNemar 检验）表明，Sansure Biotech相比具有统计学显着差异（p <0.005）。尽管 记录 ඔබ 上述 良好 统计 一致性 , 但 检验相比 සහ 显着 Несмотря на отмеченное выше хорошее stатистическое соответствие, критерий хи-квадрат (ක්රිටරි ක්වාඩ්රැට්) статистически значимую разницу (p <0,005) между анализом Sansure Biotech සහ CRS. ඉහත සඳහන් කළ හොඳ සංඛ්‍යානමය එකඟතාවයක් තිබියදීත්, කයි-චතුරස්‍ර පරීක්ෂණය (මැක්නෙමාර් පරීක්ෂණය) සැන්සුර් බයෝටෙක් විශ්ලේෂණය සහ CRS අතර සංඛ්‍යානමය වශයෙන් සැලකිය යුතු වෙනසක් (p < 0.005) පෙන්නුම් කළේය.CRS (පරිපූරක වගුව 1) හා සසඳන විට සාම්පල හයක් (3.66%) ව්‍යාජ සෘණ බව සොයා ගන්නා ලදී; මෙය ඉතා වැදගත් වේ, විශේෂයෙන් වෛරසය සම්ප්‍රේෂණය වීමේ ගතිකත්වය සැලකිල්ලට ගෙන. ඉහත දත්ත ද මෙම අඩු හඳුනාගැනීමේ අනුපාතයට සහාය වේ15.
මෙම අධ්‍යයනයේ දී, එක් එක් විශ්ලේෂණය සහ අදාළ වේදිකාව සඳහා Ct අගයන් තීරණය කරන ලද අතර, ඇබට් SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණයේ වාර්තා වූ අවම මධ්‍යන්‍ය Ct අගය සමඟින්. මෙම ප්‍රතිඵලය SARS-CoV-2 හඳුනා ගැනීම සඳහා ඇබට්ගේ සමගාමී ඒකාබද්ධ ජාන පරීක්ෂණ පද්ධතියට සම්බන්ධ විය හැකිය. එබැවින්, රූපය 1 ට අනුව, ඇබට් SARS-CoV-2 ප්‍රතිඵලවලින් 87.6% කට 20 ට අඩු Ct අගයන් තිබුණි. නියැදි ප්‍රතිඵල කුඩා සංඛ්‍යාවක් (12.4%) පමණක් 20-30 පරාසයේ තිබුණි. 30 ට වැඩි Ct අගයන් වාර්තා කර නොමැත. ඇබට් SARS-CoV-2 පැනල් ජාන පරීක්ෂණ ආකෘතිය භාවිතා කිරීමට අමතරව, මෙම ප්‍රතිඵලය පහළ හඳුනාගැනීමේ සීමාවට (RNA පිටපත් 32.5/mL)18 සම්බන්ධ විය හැකිය, එය සමාගමේ පහළ සීමාව වන RNA පිටපත් 100/mL ට වඩා තුන් ගුණයකින් අඩුය. ml)19.
මෙම අධ්‍යයනයට යම් සීමාවන් තිබේ: පළමුව, සම්පත් නොමැතිකම හේතුවෙන් අපට සම්මත/යොමු ක්‍රම [වෛරස් බර හෝ වෙනත් රසායනාගාර පරීක්ෂණ (LDA) වැනි] නොමැත. දෙවනුව, මෙම අධ්‍යයනයේදී භාවිතා කරන ලද සියලුම නිදර්ශක නාසෝෆරින්ජියල් ස්පුබ් වූ අතර, ප්‍රතිඵල අනෙකුත් නිදර්ශක වර්ග සඳහා අදාළ නොවූ අතර, තෙවනුව, අපගේ සාම්පල ප්‍රමාණය කුඩා විය.
මෙම අධ්‍යයනය මගින් නාසෝෆරින්ජියල් සාම්පල භාවිතා කරමින් SARS-CoV-2 සඳහා rRT-PCR පරීක්ෂණ හතරක කාර්ය සාධනය සංසන්දනය කරන ලදී. Sansure Biotech විශ්ලේෂණය හැරුණු විට, සියලුම හඳුනාගැනීමේ පරීක්ෂණ පාහේ සැසඳිය හැකි කාර්ය සාධනයක් තිබුණි. ඊට අමතරව, CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech විශ්ලේෂණයේදී අඩු ධනාත්මක අනුපාතය හඳුනා ගන්නා ලදී. ඊට අමතරව, CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech විශ්ලේෂණයේදී අඩු ධනාත්මක අනුපාතය හඳුනා ගන්නා ලදී. ක්‍රෝම් ටෝගෝ, в teste Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнененые по сравны 05). ඊට අමතරව, CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech පරීක්ෂණයෙන් ධනාත්මක ප්‍රතිඵලවල අඩු ප්‍රතිශතයක් පෙන්නුම් කරන ලදී.此外，与CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)。此外，与CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)。 Кроме того, analyz Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению < с, CRS (සීආර්එස් 50). ඊට අමතරව, CRS (p < 0.05) හා සසඳන විට Sansure Biotech විශ්ලේෂණයේ අඩු ධනාත්මක අනුපාතයක් තිබුණි.PPA, NPA සහ සමස්ත ගිවිසුම පිළිබඳ Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) විශ්ලේෂණය 93.5% ඉක්මවා ගිය අතර, Cohen Kappa ශක්තියේ ගිවිසුම් වටිනාකම 0.925 කි. අවසාන වශයෙන්, Sansure Biotech Assay (RUO) ඉතියෝපියාවේ භාවිතය සඳහා තවදුරටත් වලංගුකරණය අවශ්‍ය වන අතර, තනි නිෂ්පාදකයින්ගේ හිමිකම් ඇගයීම සඳහා අමතර පර්යේෂණ සලකා බැලිය යුතුය.
අඩිස් අබාබා හි සෞඛ්‍ය පහසුකම් හතරක, එකා කොටෙබේ රෝහල, මිලේනියම් පල්ලියේ ප්‍රතිකාර මධ්‍යස්ථානය, සෙවුඩිටු අනුස්මරණ රෝහල සහ ශාන්ත පීතර ක්ෂය රෝග විශේෂඥ රෝහල යන ස්ථානවල සංසන්දනාත්මක අධ්‍යයන සැලසුමක් සිදු කරන ලදී. 2020 දෙසැම්බර් 1 සහ 31 අතර දත්ත රැස් කරන ලදී. මෙම අධ්‍යයනය සඳහා වෛද්‍ය පහසුකම් හිතාමතාම තෝරා ගන්නා ලද්දේ ඒවායේ ඉහළ රෝගීන් සංඛ්‍යාව සහ නගරයේ ප්‍රධාන ප්‍රතිකාර මධ්‍යස්ථානවල ඇති හැකියාව මත ය. ඒ හා සමානව, ABI 7500 සහ ඇබට් m2000 තත්‍ය කාලීන PCR උපකරණ ඇතුළු උපකරණ, NAAT ප්‍රතික්‍රියාකාරක නිෂ්පාදකයින්ගේ නිර්දේශයන්ට අනුව තෝරා ගන්නා ලද අතර, මෙම අධ්‍යයනය සඳහා PCR හඳුනාගැනීමේ කට්ටල හතරක් තෝරා ගන්නා ලදී, මන්ද ඉතියෝපියාවේ බොහෝ රසායනාගාර අවම වශයෙන් ඒවායින් හතරක්වත් භාවිතා කළ බැවිනි. ජාන පරීක්ෂණය, ඇබට් SARS-CoV-2 පරීක්ෂණය, සැන්සුර් බයෝටෙක් පරීක්ෂණය සහ අධ්‍යයනය අතරතුර සිදු කරන ලද SARS-CoV-2 BGI පරීක්ෂණය).
SARS-CoV-2 සඳහා වන පරීක්ෂණ 2020 දෙසැම්බර් 1 සිට 30 දක්වා EPHI වෙත යොමු කරන ලද COVID-19 සඳහා විමර්ශනයට ලක්වන පුද්ගලයින්ගෙන් වෛරස් ප්‍රවාහන මාධ්‍ය (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, China) මිලි ලීටර් 3 ක් භාවිතා කරමින් සිදු කරන ලදී. පුහුණුව ලත් සාම්පල එකතු කරන්නන් විසින් නාසෝෆරින්ජියල් සාම්පල එකතු කර ත්‍රිත්ව ඇසුරුම්වල EPHI වෙත යවන ලදී. න්‍යෂ්ටික අම්ල හුදකලා කිරීමට පෙර, සෑම සාම්පලයකටම අනන්‍ය හඳුනාගැනීමේ අංකයක් පවරනු ලැබේ. අතින් සහ ස්වයංක්‍රීය නිස්සාරණ ක්‍රම භාවිතා කරමින් පැමිණි වහාම සෑම සාම්පලයකින්ම නිස්සාරණය සිදු කරනු ලැබේ. මේ අනුව, ඇබට් m2000 ස්වයංක්‍රීයව නිස්සාරණය කිරීම සඳහා, සාම්පලයේ මිලි ලීටර් 1.3 ක් (මිලි ලීටර් 0.8 ක් මළ පරිමාවක් සහ මිලි ලීටර් 0.5 ක් නිස්සාරණ ආදාන පරිමාවක් ඇතුළුව) එක් එක් සාම්පලයෙන් නිස්සාරණය කර ඇබට් DNA සාම්පල සකස් කිරීමේ පද්ධතිය (ඇබට් අණුක ඉන්කෝපරේෂන්, IL, ඇමරිකා එක්සත් ජනපදය) හරහා සම්මත කරන ලදී. ) SARS-CoV-2 (EUA) වට දෙකක තත්‍ය කාලීන ක්‍රියාවලියේ (ලබා ගැනීම සහ හඳුනා ගැනීම) සමස්ත ක්‍රියාවලියට (ලබා ගැනීම සහ හඳුනා ගැනීම) 96 ක [සාම්පල 92 ක්, හඳුනාගැනීමේ පාලන දෙකක් සහ සැකිලි නොවන පාලන දෙකක් (NTC)] ඇතුළත් විය. ඒ හා සමානව, අතින් නිස්සාරණය සඳහා, එකම සාම්පල භාවිතා කරන්න (ස්වයංක්‍රීය නිස්සාරණය සහ සොයා ගැනීම සඳහා). මේ අනුව, ක්‍රියාවලිය පුරාම, QIAamp වෛරස් RNA මිනි කට්ටලය (QIAGEN GmbH, Hilden, Germany) භාවිතයෙන් වට නවයක් පුරා කාණ්ඩ 24 කින් (සාම්පල 20 ක්, පරීක්ෂණ පාලන දෙකක් සහ NTC දෙකක් ඇතුළුව) 140 µl සාම්පල ඇලිකෝට් කර නිස්සාරණය කරන ලදී. අතින් නිස්සාරණය කරන ලද එලියුටේට් SARS-CoV-2 BGI විශ්ලේෂණය, Daan Gene විශ්ලේෂණය සහ Sansure Biotech විශ්ලේෂණය භාවිතා කරමින් ABI 7500 තාප චක්‍රයක් භාවිතයෙන් විස්තාරණය කර අනාවරණය කරන ලදී.
SARS-CoV-2 වෛරස් RNA ස්වයංක්‍රීයව හුදකලා කිරීම සහ පිරිසිදු කිරීම ඇබට් DNA සාම්පල සකස් කිරීමේ ප්‍රතික්‍රියාකාරක භාවිතයෙන් චුම්භක පබළු මූලධර්මය අනුගමනය කරයි. සාම්පල අක්‍රිය කිරීම සහ වෛරස් අංශු ද්‍රාව්‍යකරණය කිරීම ගුවානයිඩින් අයිසෝතියෝසයනේට් අඩංගු ඩිටර්ජන්ට් භාවිතයෙන් ප්‍රෝටීනය නිෂ්ක්‍රීය කර RNase අක්‍රිය කරයි. ඉන්පසු RNA සිලිකා භාවිතයෙන් ඝන අවධි වෙන් කිරීම මගින් ප්‍රෝටීනයෙන් වෙන් කරනු ලැබේ, එනම් ගුවානයිඩිනියම් ලුණු සහ ලයිසිස් බෆරයේ ක්ෂාරීය pH අගය සිලිකා (SiO2) වෙත න්‍යෂ්ටික අම්ල බන්ධනය ප්‍රවර්ධනය කරයි. සේදීමේ පියවර මඟින් පැහැදිලි ද්‍රාවණයක් නිපදවීම සඳහා ඉතිරි ප්‍රෝටීන සහ සුන්බුන් ඉවත් කරයි. උපකරණයේ චුම්භක ක්ෂේත්‍රය භාවිතා කරමින් සිලිකා මත පදනම් වූ ක්ෂුද්‍ර අංශු වලින් විනිවිද පෙනෙන RNA හුදකලා කරනු ලැබේ20,21. අනෙක් අතට, චුම්භක ස්ථාවරයක් වෙනුවට කේන්ද්‍රාපසාරීකරණය සහ ප්‍රභවයෙන් ක්ෂුද්‍ර අංශු වෙන් කිරීම භාවිතා කරමින් භ්‍රමණ තීරු ක්‍රමය මගින් අතින් හුදකලා කිරීම සහ RNA පිරිසිදු කිරීම සිදු කෙරේ.
ඇබට් රියල්-ටයිම් SARS-CoV-2 හඳුනාගැනීමේ පරීක්ෂණය (ඇබට් මොලිකියුලර්, ඉන්කෝපරේෂන්) නිෂ්පාදකයාගේ උපදෙස් අනුව සිදු කරන ලද අතර, එය WHO සහ FDA වෙතින් EUA19,22 ලබා ගන්නා ලදී. මෙම ප්‍රොටෝකෝලය තුළ, නිස්සාරණයට පෙර සාම්පල අක්‍රිය කිරීම විනාඩි 30 ක් සඳහා 56 °C දී ජල ස්නානයක සිදු කරන ලදී. වෛරස් අක්‍රිය කිරීමෙන් පසු, ඇබට් m2000 DNA සාම්පල සකස් කිරීමේ පද්ධතියක් භාවිතයෙන් 0.5 ml VTM සිට ඇබට් m2000 SP උපකරණයක් මත න්‍යෂ්ටික අම්ල නිස්සාරණය සිදු කරන ලදී. නිෂ්පාදකයාට අනුව. ඇබට් m2000 RT-PCR උපකරණයක් භාවිතයෙන් විස්තාරණය සහ අනාවරණය සිදු කරන ලද අතර, අභ්‍යන්තර පාලනයන් ඉලක්ක කර හඳුනා ගැනීම සඳහා RdRp සහ N ජාන සඳහා ද්විත්ව අනාවරණය සිදු කරන ලදී. ROX) සහ VIC P (හිමිකාර ඩයි) මඟින් විස්තාරණ නිෂ්පාදන දෙකම එකවර හඳුනා ගැනීමට ඉඩ සලසයි 19 .
මෙම කට්ටලයේ විස්තාරණ හඳුනාගැනීමේ ක්‍රමය එක්-පියවර RT-PCR තාක්ෂණය මත පදනම් වේ. ඉලක්ක කලාප විස්තාරණය හඳුනා ගැනීම සඳහා Daan Gene Technology විසින් ORF1a/b සහ N ජාන සංරක්ෂිත කලාප ලෙස තෝරා ගන්නා ලදී. සාම්පලවල SARS-CoV-2 RNA හඳුනා ගැනීම සඳහා නිශ්චිත ප්‍රයිමර් සහ ප්‍රතිදීප්ත පරීක්ෂණ (FAM සමඟ ලේබල් කරන ලද N ජාන පරීක්ෂණ, VIC සමඟ ලේබල් කරන ලද ORF1a/b පරීක්ෂණ) නිර්මාණය කර ඇත. අවසාන ප්‍රාථමික සහ ප්‍රධාන මිශ්‍රණ සකස් කරන ලද්දේ මාස්ටර් මිශ්‍රණයේ 20 µl ට එලියුන්ට් 5 µl ක් 25 µl අවසාන පරිමාවකට එකතු කිරීමෙනි. විස්තාරණය සහ අනාවරණය ABI 750024 තත්‍ය කාලීන PCR උපකරණයක් මත එකවර සිදු කරන ලදී.
Sansure Biotech nCoV-2019 න්‍යෂ්ටික අම්ල රෝග විනිශ්චය කට්ටලය (ප්‍රතිදීප්ත PCR හඳුනාගැනීම) භාවිතයෙන් ORF1a/b සහ N ජාන අනාවරණය කර ගන්නා ලදී. ORF1a/b කලාපය සඳහා FAM නාලිකාව සහ N ජානය සඳහා ROX නාලිකාව තෝරා ගැනීමෙන් එක් එක් ඉලක්කගත ජානය සඳහා නිශ්චිත පරීක්ෂණ සකස් කරන්න. මෙම විශ්ලේෂණ කට්ටලයට, ප්‍රත්‍යාවර්තක සහ ප්‍රත්‍යාස්ථ මිශ්‍ර ප්‍රතික්‍රියාකාරක පහත පරිදි එකතු කරනු ලැබේ: හඳුනාගැනීම/විස්තාරණය සඳහා 30 µl මාස්ටර් මිශ්‍ර ප්‍රතික්‍රියාකාරකයක් සහ 20 µl එලූටඩ් සාම්පලයක් සකස් කරන්න. තත්‍ය කාලීන PCR ABI 750025 විස්තාරණය/අනාවරණය සඳහා භාවිතා කරන ලදී.
SARS-CoV-2 BGI පරීක්ෂණය යනු COVID-19 රෝග විනිශ්චය සඳහා ප්‍රතිදීප්ත තත්‍ය කාලීන rRT-PCR කට්ටලයකි. ඉලක්ක කලාපය SARS-CoV-2 ජෙනෝමයේ ORF1a/b කලාපයේ පිහිටා ඇති අතර එය තනි ජාන හඳුනාගැනීමේ ක්‍රමයකි. ඊට අමතරව, මිනිස් ගෘහ පාලන ජානය β-ඇක්ටින් යනු අභ්‍යන්තරව නියාමනය කරන ලද ඉලක්ක ජානයකි. මාස්ටර් මිශ්‍රණය සකස් කරනු ලබන්නේ මාස්ටර් මිශ්‍රණ ප්‍රතික්‍රියාකාරකයේ 20 µl සහ නිස්සාරණය කරන ලද RNA සාම්පලයේ 10 µl ළිං තහඩුවක මිශ්‍ර කිරීමෙනි26. විස්තාරණය සහ අනාවරණය සඳහා ABI 7500 ප්‍රතිදීප්ත ප්‍රමාණාත්මක තත්‍ය කාලීන PCR උපකරණයක් භාවිතා කරන ලදී. සියලුම න්‍යෂ්ටික අම්ල විස්තාරණය, එක් එක් විශ්ලේෂණය සඳහා PCR ධාවන කොන්දේසි සහ ප්‍රතිඵල අර්ථ නිරූපණය කිරීම අදාළ නිෂ්පාදකයාගේ උපදෙස් අනුව සිදු කරන ලදී (වගුව 3).
මෙම සංසන්දනාත්මක විශ්ලේෂණයේදී, විශ්ලේෂණ හතර සඳහා ප්‍රතිශත එකඟතාව (ධනාත්මක, සෘණ සහ සමස්ත) සහ අනෙකුත් සංසන්දන පරාමිතීන් තීරණය කිරීම සඳහා අපි යොමු සම්මත ක්‍රමය භාවිතා නොකළෙමු. සෑම පරීක්ෂණ සංසන්දනයක්ම CRS සමඟ සිදු කරන ලද අතර, මෙම අධ්‍යයනයේදී CRS "ඕනෑම ධනාත්මක" රීතිය මගින් සකසා ඇති අතර ප්‍රතිඵලය තීරණය කරන ලද්දේ තනි පරීක්ෂණයකින් නොව, අවම වශයෙන් ගැලපෙන පරීක්ෂණ ප්‍රතිඵල දෙකක්වත් භාවිතා කරමිනි. ඊට අමතරව, COVID-19 සම්ප්‍රේෂණය සම්බන්ධයෙන්, ව්‍යාජ සෘණ ප්‍රතිඵල ව්‍යාජ ධනාත්මක ප්‍රතිඵලවලට වඩා භයානක ය. එබැවින්, CRS ප්‍රතිඵලයකින් හැකි තරම් නිවැරදිව "ධනාත්මක" යැයි පැවසීමට, අවම වශයෙන් පරීක්ෂණ පරීක්ෂණ දෙකක්වත් ධනාත්මක විය යුතුය, එනම් අවම වශයෙන් එක් ධනාත්මක ප්‍රතිඵලයක් EUA විශ්ලේෂණයකින් පැමිණීමට ඉඩ ඇත. මේ අනුව, පරීක්ෂණ ප්‍රතිඵල හතරෙන්, එකම ප්‍රතිඵලය ලබා දෙන පරීක්ෂණ ප්‍රතිඵල දෙකක් හෝ වැඩි ගණනක් සත්‍ය ධනාත්මක හෝ සෘණ ලෙස සැලකේ18,27.
ව්‍යුහගත දත්ත නිස්සාරණ ආකෘති භාවිතයෙන් දත්ත රැස් කරන ලදී, එක්සෙල් සංඛ්‍යාන මෘදුකාංග සහ විස්තරාත්මක සංඛ්‍යාලේඛන සඳහා SPSS අනුවාදය 23.0 භාවිතයෙන් දත්ත ඇතුළත් කිරීම සහ විශ්ලේෂණය සිදු කරන ලදී. ධනාත්මක, සෘණ සහ සමස්ත ප්‍රතිශත එකඟතාවය විශ්ලේෂණය කරන ලද අතර, CRS සමඟ එක් එක් ක්‍රමයේ එකඟතාවයේ මට්ටම තීරණය කිරීම සඳහා කැපා ලකුණු භාවිතා කරන ලදී. කැපා අගයන් පහත පරිදි අර්ථ දැක්වේ: මෘදු එකඟතාවය සඳහා 0.01 සිට 0.20 දක්වා, සාමාන්‍ය එකඟතාවය සඳහා 0.21 සිට 0.40 දක්වා, මධ්‍යස්ථ එකඟතාවය සඳහා 0.41-0.60, ප්‍රධාන එකඟතාවය සඳහා 0.61-0.80 සහ සම්පූර්ණ එකඟතාවය සඳහා 0.81-0.9928.
අඩිස් අබාබා විශ්ව විද්‍යාලයෙන් සදාචාරාත්මක අවසරය ලබා ගත් අතර මෙම අධ්‍යයනය සඳහා වූ සියලුම පර්යේෂණාත්මක ප්‍රොටෝකෝල ඉතියෝපියානු මහජන සෞඛ්‍ය ආයතනයේ විද්‍යාත්මක ආචාර ධර්ම සමාලෝචන මණ්ඩලය විසින් අනුමත කරන ලදී. EPHI ආචාර ධර්ම බලපත්‍රය සඳහා යොමු අංකය EPHI/IRB-279-2020 වේ. COVID-19 ප්‍රතිකාර සඳහා ඉතියෝපියානු ජාතික විස්තීර්ණ මාර්ගෝපදේශවල නිර්දේශ සහ විධිවිධානවලට අනුකූලව සියලුම ක්‍රම යොදා ගන්නා ලදී. ඊට අමතරව, අධ්‍යයනයට සහභාගී වීමට පෙර සියලුම අධ්‍යයන සහභාගිවන්නන්ගෙන් ලිඛිත දැනුම්වත් කැමැත්ත ලබා ගන්නා ලදී.
මෙම අධ්‍යයනයෙන් ලබාගත් හෝ විශ්ලේෂණය කරන ලද සියලුම දත්ත මෙම ප්‍රකාශිත ලිපියට ඇතුළත් කර ඇත. මෙම අධ්‍යයනයේ ප්‍රතිඵල සඳහා සහාය වන දත්ත සාධාරණ ඉල්ලීමක් මත අදාළ කතුවරයාගෙන් ලබා ගත හැකිය.
ලෝක සෞඛ්‍ය සංවිධානය. COVID-19 සඳහා රසායනාගාර පරීක්ෂණ උපාය මාර්ග සඳහා නිර්දේශ: අතුරු මාර්ගෝපදේශය, 2020 මාර්තු 21 අංකය WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020).
මවුලියෝ, ඩීඑස්, පැන්ටසොපොලොස්, අයි. සහ ගුර්ගොලියානිස්, කේඅයි හදිසි ප්‍රතිකාර අංශයේ COVID-19 ස්මාර්ට් රෝග විනිශ්චය: සියල්ල ප්‍රායෝගිකව. මවුලියෝ, ඩීඑස්, පැන්ටසොපොලොස්, අයි. සහ ගුර්ගොලියානිස්, කේඅයි හදිසි ප්‍රතිකාර අංශයේ COVID-19 ස්මාර්ට් රෝග විනිශ්චය: සියල්ල ප්‍රායෝගිකව.මුලියෝ, ඩීඑස්, පැන්ටසොපොලොස්, අයි. සහ ගුර්ගුලියානිස්, කේඅයි හදිසි ප්‍රතිකාර අංශයේ COVID-19 පිළිබඳ බුද්ධිමත් රෝග විනිශ්චය: ප්‍රායෝගිකව සියල්ල.මුලියෝ ඩීඑස්, පැන්ටසොපොලොස් අයි. සහ ගුර්ගුලියානිස් කේඅයි හදිසි දෙපාර්තමේන්තු වල COVID-19 හි බුද්ධිමත් රෝග විනිශ්චය: ප්‍රායෝගිකව අන්තයේ සිට අවසානය දක්වා ඒකාබද්ධ කිරීම. විශේෂඥ පූජක ශ්වසනය. වෛද්‍ය විද්‍යාව. 3, 263–272 (2022).
මිචෙල්, SL සහ ශාන්ත ජෝර්ජ්, කේ. COVID19 ID NOW EUA තක්සේරුව ඇගයීම. මිචෙල්, SL සහ ශාන්ත ජෝර්ජ්, කේ. COVID19 ID NOW EUA තක්සේරුව ඇගයීම.මිචෙල්, SL සහ ශාන්ත ජෝර්ජ්, K. COVID19 ID NOW EUA තක්සේරුව ඇගයීම.මිචෙල් එස්එල් සහ ශාන්ත ජෝර්ජ් කේ. COVID19 ID NOW EUA විශ්ලේෂණය ඇගයීම. ජේ. සායනික. වෛරස්. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
WHO. සැක සහිත මිනිස් රෝග වල කොරෝනා වයිරස් රෝගය 2019 (COVID-19) රසායනාගාර හඳුනාගැනීම. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (2020 අගෝස්තු 15 දින ප්‍රවේශ විය) (WHO, 2020).
උඩුගම, බී. සහ තවත් අය. COVID-19 රෝග විනිශ්චය: රෝග සහ පරීක්ෂණ මෙවලම්. ACS නැනෝ 14(4), 3822–3835 (2020).
සයිඩ් එස්. සහ තවත් අය. නැගෙනහිර, මධ්‍යම සහ දකුණු අප්‍රිකාවේ ව්‍යාධි විද්‍යාඥයින්ගේ විද්‍යාලය පිහිටුවීම - මැද පෙරදිග සහ දකුණු අප්‍රිකාවේ ව්‍යාධි විද්‍යා කලාපීය පාසල. අප්‍රිකාව. ජේ. රසායනාගාර වෛද්‍ය විද්‍යාව. 9(1), 1-8 (2020).
ඉතියෝපියානු මහජන සෞඛ්‍ය ආයතනය, ෆෙඩරල් සෞඛ්‍ය අමාත්‍යාංශය. COVID-19 රසායනාගාර රෝග විනිශ්චය සඳහා අන්තර්කාලීන ජාතික උපායමාර්ගය සහ මාර්ගෝපදේශය. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (2020 අගෝස්තු 12 දින ප්‍රවේශ විය) (EPHI, 2020).
වොලොෂින්, එස්., පටෙල්, එන්. සහ කෙසෙල්හයිම්, ඒඑස් SARS-CoV-2 ආසාදන අභියෝග සහ ඇඟවුම් සඳහා ව්‍යාජ සෘණ පරීක්ෂණ. වොලොෂින්, එස්., පටෙල්, එන්. සහ කෙසෙල්හයිම්, ඒඑස් SARS-CoV-2 ආසාදන අභියෝග සහ ඇඟවුම් සඳහා ව්‍යාජ සෘණ පරීක්ෂණ.වොලොෂින් එස්., පටෙල් එන්. සහ කෙසෙල්හයිම් ඒඑස් SARS-CoV-2 ආසාදන සහ ඒවායේ ප්‍රතිවිපාක සඳහා ව්‍යාජ-සෘණ පරීක්ෂණ.වොලොෂින් එස්., පටෙල් එන්. සහ කෙසෙල්හයිම් ඒඑස් SARS-CoV-2 ආසාදනයේ ප්‍රකෝප කිරීම සහ බලපෑම සඳහා ව්‍යාජ-සෘණ පරීක්ෂණ. එන්. ඉංජිනේරු. ජේ. වෛද්‍ය විද්‍යාව. 383(6), e38 (2020).
මවුලියෝ, ඩීඑස් සහ ගුර්ගොලියානිස්, කේඅයි ව්‍යාජ-ධනාත්මක සහ ව්‍යාජ-සෘණ COVID-19 අවස්ථා: ශ්වසන වැළැක්වීමේ සහ කළමනාකරණ උපාය මාර්ග, එන්නත් කිරීම සහ වැඩිදුර ඉදිරිදර්ශන. මවුලියෝ, ඩීඑස් සහ ගුර්ගොලියානිස්, කේඅයි ව්‍යාජ-ධනාත්මක සහ ව්‍යාජ-සෘණ COVID-19 අවස්ථා: ශ්වසන වැළැක්වීමේ සහ කළමනාකරණ උපාය මාර්ග, එන්නත් කිරීම සහ වැඩිදුර ඉදිරිදර්ශන. Mouliou, DS සහ Gourgoulianis, KI ලොපොලොජිටේල්නි සහ ලොජිනෝට්‍රිසාටෙලිනීස් ප්‍රකාශන කොවිඩ්-19: රෙස්පයිරටෝර්නියා ප්‍රොෆික්ටික් лечения, вакцинация и дальнейшие перспективы. මවුලියෝ, ඩීඑස් සහ ගුර්ගොලියානිස්, කේඅයි COVID-19 හි ව්‍යාජ ධනාත්මක සහ ව්‍යාජ සෘණාත්මක අවස්ථා: ශ්වසන වැළැක්වීම සහ ප්‍රතිකාර උපාය මාර්ග, එන්නත් කිරීම සහ ඉදිරි මාවත.මුලියු, ඩීඑස් සහ ගුර්ගුලියානිස්, කේඅයි COVID-19 හි ව්‍යාජ-ධනාත්මක සහ ව්‍යාජ-සෘණ අවස්ථා: ශ්වසන වැළැක්වීම සහ ප්‍රතිකාර සඳහා උපාය මාර්ග, එන්නත් කිරීම සහ ඉදිරි මාවත. විශේෂඥ පූජක ශ්වසනය. වෛද්‍ය විද්‍යාව. 15(8), 993–1002 (2021).
මවුලියෝ, ඩීඑස්, අයෝනිස්, පී. සහ කොන්ස්ටන්ටිනෝස්, ජී. හදිසි ප්‍රතිකාර අංශයේ COVID-19 රෝග විනිශ්චය: ගස දුටු නමුත් වනාන්තරය අහිමි වීම. මවුලියෝ, ඩීඑස්, අයෝනිස්, පී. සහ කොන්ස්ටන්ටිනෝස්, ජී. හදිසි ප්‍රතිකාර අංශයේ COVID-19 රෝග විනිශ්චය: ගස දුටු නමුත් වනාන්තරය අහිමි වීම.මවුලියෝ, ඩීඑස්, අයෝනිස්, පී. සහ කොන්ස්ටන්ටිනෝස්, ජී. හදිසි ප්‍රතිකාර අංශයේ COVID-19 රෝග විනිශ්චය: ගස බලන්න, වනාන්තරය අහිමි කරන්න.මුලියෝ ඩීඑස්, අයෝනිස් පී., සහ කොන්ස්ටන්ටිනොස් ජී. හදිසි කාමරවල COVID-19 රෝග විනිශ්චය: ගස් සඳහා ප්‍රමාණවත් වනාන්තරයක් නොමැත. පෙනී සිටින්න. වෛද්‍ය විද්‍යාව. ජේ. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
ඩෙග්ලි-ඇන්ජලි, ඊ. සහ තවත් අය. ඇබට් රියල් ටයිම් SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණයේ විශ්ලේෂණාත්මක සහ සායනික කාර්ය සාධනය වලංගු කිරීම සහ වලංගු කිරීම. J. සායනික. වෛරසය. 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
මොල්ලෙයි, එච්ආර්, අෆ්ෂාර්, ඒඒ, කලන්තාර්-නීස්ටනාකි, ඩී., ෆස්ලලිපෝර්, එම්. සහ අෆ්ලටූනියන්, බී. සාම්ප්‍රදායික RT-PCR මගින් වෛරස් ආසාදනය හඳුනා ගැනීම සඳහා COVID-19 හි විවිධ ජෙනෝම කලාපවලින් ප්‍රයිමර් කට්ටල පහක් සංසන්දනය කිරීම. මොල්ලෙයි, එච්ආර්, අෆ්ෂාර්, ඒඒ, කලන්තාර්-නීස්ටනාකි, ඩී., ෆස්ලාලිපෝර්, එම්. සහ අෆ්ලාටූනියන්, බී. සාම්ප්‍රදායික RT-PCR මගින් වෛරස් ආසාදනය හඳුනා ගැනීම සඳහා COVID-19 හි විවිධ ජෙනෝම කලාපවලින් ප්‍රයිමර් කට්ටල පහක් සංසන්දනය කිරීම.මොල්ලෙයි, එච්ආර්, අෆ්ෂාර්, ඒඒ, කලන්තාර්-නීස්ටනාකි, ඩී., ෆස්ලලිපෝර්, එම්. සහ අෆ්ලාටුන්යන්, බී. සාම්ප්‍රදායික RT-PCR මගින් වෛරස් ආසාදනය හඳුනා ගැනීම සඳහා COVID-19 ජෙනෝමයේ විවිධ ප්‍රදේශවලින් ලබාගත් ප්‍රයිමර් කට්ටල පහක සංසන්දනය. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组，用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染。 මොල්ලෙයි, එච්ආර්, අෆ්ෂාර්, ඒඒ, කලන්තාර්-නීස්ටනාකි, ඩී., ෆස්ලාලිපෝර්, එම්. සහ අෆ්ලාටූනියන්, බී. සාම්ප්‍රදායික RT-PCR මගින් වෛරස් ආසාදනය හඳුනා ගැනීම සඳහා COVID-19 හි විවිධ ජානමය කලාප 5 ක සංසන්දනය.මොල්ලෙයි එච්ආර්, අෆ්ෂාර් ඒඒ, කලන්තාර්-නීස්ටනාකි ඩී, ෆස්ලාලිපෝර් එම්. සහ අෆ්ලාටුන්යන් බී. සාම්ප්‍රදායික RT-PCR මගින් වෛරස් ආසාදනය හඳුනා ගැනීම සඳහා COVID-19 ජෙනෝමයේ විවිධ ප්‍රදේශවලින් ලබාගත් ප්‍රයිමර් කට්ටල පහක සංසන්දනය.ඉරානය. ජේ. ක්ෂුද්‍රජීව විද්‍යාව. 12(3), 185 (2020).
ගොර්ට්සර්, අයි. සහ තවත් අය. SARS-CoV-2 ජෙනෝම අනුපිළිවෙල හඳුනා ගැනීම සඳහා වූ ජාතික බාහිර තත්ත්ව තක්සේරු වැඩසටහනේ මූලික ප්‍රතිඵල. ජේ. සායනික. වෛරස්. 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
වැන්ග්, එම්. සහ තවත් අය. දරුණු උග්‍ර ශ්වසන සින්ඩ්‍රෝම් කොරෝනා වයිරස් සඳහා RT-PCR කට්ටල පහක කාර්යක්ෂමතාව පිළිබඳ විශ්ලේෂණාත්මක ඇගයීම 2. J. සායනික. රසායනාගාරය. ගුදය. 35(1), e23643 (2021).
Wang B. et al. තත්‍ය කාලීන පොලිමරේස් දාම ප්‍රතික්‍රියාව (PCR) මත පදනම්ව චීනයේ වාණිජමය වශයෙන් ලබා ගත හැකි SARS-CoV-2 RNA හඳුනාගැනීමේ කට්ටල හතක් ඇගයීම. සායනික. රසායනික. රසායනාගාරය. වෛද්‍ය විද්‍යාව. 58(9), e149–e153 (2020).
van Casteren, PB et al. වාණිජ RT-PCR COVID-19 රෝග විනිශ්චය කට්ටල හතක සංසන්දනය. J. Clinical. Virus. 128, 104412 (2020).
ලු, යූ, සහ තවත් අය. SARS-CoV-2 න්‍යෂ්ටික අම්ල හඳුනා ගැනීම සඳහා PCR කට්ටල දෙකක රෝග විනිශ්චය කාර්ය සාධනය සංසන්දනය කිරීම. J. සායනික. රසායනාගාරය. ගුදය. 34(10), e23554 (2020).
ලෙෆාර්ට්, පීආර්, ආදිය. SARS-CoV-2 න්‍යෂ්ටික අම්ල විස්තාරණ පරීක්ෂණ (NAAT) වේදිකා හතරක් පිළිබඳ සංසන්දනාත්මක අධ්‍යයනයකින් පෙන්නුම් කළේ රෝගියා සහ සාම්පල වර්ගය අනුව ID NOW ක්‍රියාකාරිත්වය සැලකිය යුතු ලෙස පිරිහී ඇති බවයි. රෝග විනිශ්චය. ක්ෂුද්‍රජීව විද්‍යාව. ආසාදනය. diss. 99(1), 115200 (2021).
ඇබට් අණුව. ඇබට් තත්‍ය කාලීන SARS-CoV-2 විශ්ලේෂණ පැකේජ ඇතුළත් කිරීම. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (2020 අගෝස්තු 10 වන දිනට) (2020).
ක්ලයින්, එස්. සහ තවත් අය. RT-qPCR සහ RT-LAMP මගින් වේගවත් මහා පරිමාණ අනාවරණය සඳහා චුම්බක පබළු භාවිතා කරමින් SARS-CoV-2 RNA හුදකලා කිරීම. වෛරස් 12(8), 863 (2020).